Enstitümüz Doğu Anadolu Bölgesine (Ağrı, Ardahan, Artvin, Bayburt, Erzincan, Erzurum, Gümüşhane, Iğdır ve Kars) hizmet vermek üzere 1966 yılında kurulmuş olup, Ülkemiz ve bölge hayvancılığına yönelik önemli hizmetlerde ve katkıda bulunmuştur.
Enstitümüzün amaçları bölgede salgın hastalıklar ile mücadele, teşhis hizmetleri, araştırma ve epidemiyolojik çalışmaların yürütülmesi, Veteriner Hekim, Veteriner Sağlık Teknisyenleri ve Sağlık teknikerlerine  yönelik eğitim çalışmaları yapmaktır.

Ayrıca ülkesel ve bölgesel bazda hayvan hastalıklarının epidemiyolojisi, kontrol ve eradikasyonuna yönelik araştırmalar, şüpheli materyalden hastalık etkenlerinin izolasyon ve identifikasyonları ile serolojik teşhisleri yapmak  yine T.A.G.E.M (Tarımsal Araştırmaları ve Politikaları  Genel Müdürlüğü’nce) belirlenen konularda araştırmalar yürütmek  ve G.K.G.M. (Gıda ve Kontrol Genel Müdürlüğü) tarafından belirlenen konularda da taşra teşkilatında görevli personele eğitim verilmektir. Hizmet sunulan 9 Gıda, Tarım ve Hayvancılık İl Müdürlükleri’nce  uzman talepleri karşılanmaya çalışılmaktadır.  
Pandemi özelliği olan hayvan hastalıkları mobil hareket edebilen uzman ekip ve laboratuar altyapısı ile hazır durumda olmak ve gerektiğinde müdahale edebilmek de çalışma esasları içerisindedir.